對于新三板企業估值，中國銀河證券研究部宏觀、策略與新三板部負責人孫建波認為，新三板企業的估值不是將主板的對標企業估值打折這么簡單。A股市場與新三板市場的行情聯動也不完全是估值傳導的結果。

　　從宏觀角度分析，A股市場的上市公司與新三板市場的掛牌企業都會受到宏觀經濟因素的影響，上市公司的抗風險能力大于中小微企業。因此，當A股市場下跌時，新三板市場同樣也會下跌，并且跌幅往往會大于A股市場，反之亦然。

　　孫建波認為，新三板的投資策略就是創新服務策略，或者說是投資新三板企業的業務發展戰略，將新三板企業的發展戰略與創投服務相結合，實現產業與資本共贏，實現企業家與資本共贏。而市值管理是幫助企業做好業務規劃和發展戰略的解決方案。

　　孫建波認為，企業估值與市值管理的關系主要體現在三個方面。

　　首先，新三板企業處在發展初期，很多企業還需要持續孵化，這就需要有經驗的投資機構來輔導，幫助這類企業制定明確的產業規劃和清晰的規劃路線。業務規劃得到投資者認可，才會在股價上有所體現。可見，新三板企業的股價是建立在業務規劃的基礎之上，企業的估值則是對業務規劃可行性的體現。

　　其次，新三板是一個分階段的市場，在不同階段之間需形成資本的良性循環。新三板內部是一個多層次的資本市場，不同的層次對應企業發展的不同階段，企業的不同發展階段對應不同的機構投資。投資機構扶持企業到一定階段后，需傳給下一家適合企業下一發展階段的投資機構，從而形成資本進入和退出的良性循環，良性的循環才能形成企業合理的估值。

　　最后，要與新三板的實際情況相結合。由于新三板的制度建設正在不斷完善，企業發展速度加快，這有利于新三板企業在業務規劃和資本戰略方面快速實現。因此，企業與投資方需要根據政策變化不斷調整和配合，這種配合就形成了企業在二級市場的交易價格。

　　值得注意的是，投資機構需要建立與投資人之間的溝通渠道，企業的問題會直接體現在股價和流動性上，因此，企業發展的關鍵事件都要爭取投資人的意見，這樣才能做好新三板的投資，也是對企業負責。